崇祯六年九月十八日，以及之后的几天里，清军派遣军到达了九州岛的南端，实现了对九州岛的全部占领，战事暂时告一段落。清国需要一段时间建立完善政权，制定对待日本人的政策，制造一个平稳安定的环境，在新的制度下恢复农业生产，巩固社会政治、经济各个方面的秩序。
九州岛原有日本人口150万到200万之间，逃走一部分，但是估计逃走都是社会的上层人口，数量不会太多，被清军屠杀的数量很大，估计超过百万之众。按清国初步的统计，当前九州岛上日本人还有大约40万，清国的政策是把剩余的日本人全部分配给各旗（包括蒙古的旗）的民户做奴隶。40万人这个数字也已经接近了清国本身加上部分蒙古人的总和，对于清国来说还是太多了，日本还有三个岛呐，要是每个岛都留下40万那还了得？但是大规模的杀戮已经不可能，只能今后慢慢的减丁。
比如国防军要求的首批一万年轻女子，现在就可以选送过去。对于这批人，朱万化规定的就是移民身份，国防军给清国一些补偿从其他方面体现出来，反正是，绝对不准说成是买卖人口。并且今后还会有后续的移民要求，并且可能还会有男性的日本人。
清国对待日本人奴隶，首先就要求改变发型、服饰，一律女真族人的装束打扮，男人当然要留辫子。日本人不要说反抗，稍有不满就会遭到满门的屠杀，因为清军正在寻找屠杀的借口，送上门的岂有不用之理。
其次是语言，日本语言文字全部废止，不允许写，也不允许说！只能说女真族语言或者汉语，暂时不会说就得装哑巴了，因为用日本语对话也是死罪！
然后还有名字，日本人多数没有名字，但是阿猫阿狗的也有个习惯的叫法。清国就学习了朱万化的政策，规定全部要使用女真人习惯的名字，汉语名字也可以，绝对不允许日本的名字存在。
对于民族问题，清国的上层人士还在研究，他们也倾向于定下一个统一民族的政策。
历史上，清兵入关之后，他们就把八旗之下的女真人改为满族，“满”字来源于满洲。
“满洲”二字兼有部族和地域的概念，做地域解释时，它是对东北地区的泛称。做部族解释时，它泛指八旗中的女真人。深究起来，它来源于藏语的汉译词汇“曼珠”，是颂扬吉祥的意思，之后“曼珠”二字演化为“满洲”。由此也可以看出清国上层与藏传佛教关系密切。
那么历史上的满族的组成会不会有所改变呢？我们拭目以待。
清国对日本人的政策中还有一项更厉害，自称是武士的人，带武士刀的日本人，杀无赦！在清国的土地上不允许武士的存在！
清国对日本人绝对是高压政策。
在以范文程为首的官员们的努力下，各级政权也建立起来。他们仿照大明的方式，把九州岛设为行省，但是“九州”二字不当，应该废止，改为“南满省”，九州岛也就更名为南满岛。省下设县，政权到村一级，但是有品级的官员到县一级为止。
清国还有一项重大的改革，那就是把大明的科举制度照搬过来，明年即开乡试。武举同时举行。
之所以说这是一项重大措施，是因为它彻底的改变了日本的社会结构。日本的社会结构是：武士、农、工商、贱民，日本就是以武士为主体的社会，日本没有科举，也就没有知识分子阶层。大明的社会结构是：士、农、工、商，“士”就是士绅，是以科举知识分子为主体的。
清国用科举制度，再辅助以杀武士的政策，就彻底的消灭日本的原有社会结构，也就消灭了日本人的劣根。
确定科举制也是一箭双雕的好举措。
......
随着南满省（九州）的建立，整个南满岛逐渐平定，走上正常运作的轨道，国防军也派出了农业技术人员帮助他们恢复生产，清国也就有了稳固的根基。按照双方的协定，从现在起，清国就要陆续的退出辽东之地了。
于是朱万化致信给皇太极，要求他安排逐步退出辽东的计划，并且安排出第一批应退出的土地，以便双方交接，同时双方的经济基金会进行具体的折价运作。
理论上说，从辽宁向北直到东西伯利亚都是清国的国土，但是，他们实际的军事力量达到的地方就是松花江一带，并且所驻扎的军队极少，最大的力量就是吉林将军府、宁古塔（今牡丹江之南的宁安）将军府，他们距离黑龙江还很远。到了黑龙江沿岸地区，他们既没有军队，更没有作为政权的官府。
不要说清国，就算清国兴起之前，大明帝国的官府对那里的管理也是很弱的，明朝在黑龙江流域有一个被称为努尔干都司的官府机构，也是非常初级的政权。
朱万化向辽宁巡抚王元雅下达了指令：现在就要做好接收的准备，首要的是准备大批的官员，年后，趁着天气转暖，就要开始接收。
去年，山东省曾经支援他们大批的学员，辽宁的政务学校规模已经极度扩大，学员总数已经超过了千人，即便把这些人都用上，辽阔的北方地区，也只能完成粗线条的管理。
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